Η κοιλάδα του Κομψάτου είναι από τις σημαντικότερες περιοχές της Ελλάδας για τα αρπακτικά πουλιά. Έχουν παρατηρηθεί 128 είδη πουλιών, ανάμεσα στα οποία πολλά είναι απειλούμενα σε εθνικό ή διεθνές επίπεδο. Στην ποικιλία των ειδών που απαντούν εδώ συμβάλλει και η γειτνίαση της περιοχής με τα βουνά του Έβρου, την κοιλάδα του Φιλιούρη και τη λίμνη Βιστωνίδα.

Στην περιοχή έχει παρατηρηθεί ένα παγκοσμίως απειλούμενο είδος, ο Βασιλαετός Aquila heliaca, και 6 κινδυνεύοντα σε ευρωπαϊκό επίπεδο. Σε εθνικό επίπεδο, 19 είδη περιλαμβάνονται στο "Κόκκινο Βιβλίο των Απειλούμενων Σπονδυλόζωων της Ελλάδας", από τα οποία 6 κινδυνεύουν με εξαφάνιση, 7 είναι τρωτά και 4 είναι σπάνια. 35 είδη περιλαμβάνονται στο Παράρτημα Ι της Οδηγίας 79/409/ΕΟΚ.

Phalacrocorax pygmaeus: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως κινδυνεύον με εξαφάνιση

Ciconia nigra: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως κινδυνεύον με εξαφάνιση

Haliaeetus albicilla: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως κινδυνεύον άμεσα με εξαφάνιση

Neophron percnopterus: κινδυνεύει στην Ευρώπη και περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως τρωτό

Gyps fulvus: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως τρωτό

Aegypius monachus: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως κινδυνεύον άμεσα με εξαφάνιση

Circus aeruginosus: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως τρωτό

Circus macrourus: κινδυνεύει στην Ευρώπη

Circus pygargus: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως κινδυνεύον άμεσα με εξαφάνιση

Buteo rufinus: κινδυνεύει στην Ευρώπη και περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως σπάνιο

Aquila pomarina: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως τρωτό

Aquila heliaca: παγκοσμίως απειλούμενο, κινδυνεύει στην Ευρώπη και περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως κινδυνεύον άμεσα με εξαφάνιση

Aquila chrysaetos: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως τρωτό

Hieraaetus pennatus: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως τρωτό

Falco eleonorae: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως ανεπαρκώς γνωστό

Falco biarmicus: κινδυνεύει στην Ευρώπη και περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως τρωτό

Falco peregrinus: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως ανεπαρκώς γνωστό

Columba oenas: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως σπάνιο

Picus canus: περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως σπάνιο

Ficedula semitorquata: κινδυνεύει στην Ευρώπη και περιλαμβάνεται στο Κόκκινο Βιβλίο των Απειλουμένων Σπονδυλοζώων της Ελλάδας ως σπάνιο.